流式可以检测的样本很多：细胞表面的蛋白，通过荧光抗体直接标记细胞内部的蛋白，细胞固定，通透后再用荧光抗体识别细胞内部的DNA含量，细胞固定，通透后加DNA染料细胞内部钙离子浓度，直接加钙离子浓度荧光染料染色细胞内部线粒体膜电位，比如JC-1，罗丹明染料使用微球阵列，可以同时检测溶液中数十种可溶性蛋白的浓度
流式细胞仪（Flow cytometer ）是对细胞进行自动分析和分选的装置。它可以快速测量、存贮、显示悬浮在液体中的分散细胞的一系列重要的生物物理、生物化学方面的特征参量，并可以根据预选的参量范围把指定的细胞亚群从中分选出来。多数流式细胞计是一种零分辨率的仪器，它只能测量一个细胞的诸如总核酸量，总蛋白量等指标，而不能鉴别和测出某一特定部位的核酸或蛋白的多少。也就是说，它的细节 分辨率为零。
细胞或者其他颗粒状的物体可以被荧光标记的抗体或者替他荧光染料染色。当这些被标记的物体通过流式细胞仪的时候，激光照射，得到不同的激发光。用途：1. 临床诊断：比如白血病，淋巴瘤的分型，可以指导治疗。检测干细胞的百分率，可以判断干细胞治疗的效果等等2. 实验研究。根据前面所说的原理。只要可以被染色的，都可以用流式来分析。可以检查各种抗原的含量。代谢状态等等。3. 细胞的分选。最后，根据染色的状态，可以把不同的细胞筛选出来，进行下一步的研究。
根据配置，价格从几十万都几百万不等。
但并不是所有的流式细胞仪都可以做临床检验的，只有授予证书的少数几款才可以。由于研究的就没有限制了。
